Arlequin是一款遗传学分析管理工具，通过此软件能够帮助我们对相关数据进行快速分析和管理，更有效更快地读取长DNA序列，Arlequin现在可以读取多达100万个字符的行，删除了xml文件中的非法字符，软件简单又实用，大大提高了工作效率，有需要的朋友赶紧下载吧。

Arlequin功能介绍

1、Arlequin配置。

2、可以按“编辑项目”按钮编辑项目。

3、左侧列中有相应的组标识符。

4、将项目文件加载到Arlequin中。

5、如果项目文件有效，则其主要属性将显示在“项目”选项卡中。

Arlequin软件特色

标准指数

一些多样性测量，如多态性位点的数量，基因多样性。

分子多样性

计算几个多样性指数，如核苷酸多样性，群体参数θ的不同估计量。

不匹配分布

单倍型之间成对差异数量的分布，可以估计人口统计学（新）或空间人口扩张的参数

单倍型频率估计

通过最大似然法估计群体中存在的单倍型的频率。

配子相位估计（新）

估计最喜欢的游戏阶段

使用伪贝叶斯方法（ELB算法）的多基因座基因型。

连锁不平衡

在不同位点测试等位基因的非随机关联

更新日志

无法打开批处理（.arb）文件

当（假设祖先等位基因0）在一个站点不存在时，SFS计算不良

由arlequin和fastsimcoal2生产的不同SFS（主要用于基于MAF的SFS）

如果文件名超过255个字符，则会出错

在arlequin日志文件中没有提到SFS计算